机器学习算法幻化出新的蛋白质结构的简单介绍

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1蛋白质工程中对蛋白质的结构进行分子设计,替换或剔除某个氨基酸。_百度...

蛋白质工程可以对已有蛋白质进行改造或直接创造一种新的蛋白质。蛋白质的氨基酸种类，数量，排列顺序和空间结构的不同造成了他的多样性，即特异性。

蛋白质工程的目标是，根据人们对蛋白质的功能的特定需求，对蛋白质结构进行分子设计。蛋白质工程的原理，就是指在进行相关操作时遵循的基本原理。

蛋白质工程技术应用在食品，化妆品，医疗，工业，农业等方面。蛋白质工程的目标是根据人们对蛋白质功能的特定需求，对蛋白质的结构进行分子设计。

2蛋白质结构式

蛋白质结构通式文字表达：中间一个碳原子，连有一个氢，一个氨基，一个羧基还有一个R基。这个R基的不同就代表着不同的氨基酸，比如甘氨酸的R基是H，丙氨酸的R基是CH3-等肽键形成：由氨基脱去H，羧基脱去-OH而形成的酰胺键。

蛋白质的结构简式图如下：蛋白质结构是指蛋白质分子的空间结构。

蛋白质结构通式文字表达：中间一个碳原子，连有一个氢，一个氨基，一个羧基还有一个R基。

蛋白质的结构是：蛋(上下结构)白(独体结构)质(半包围结构)。注音是：ㄉㄢ_ㄅㄞ_ㄓ_。拼音是：dànbáizhì。词性是：名词。

蛋白质四级结构：在体内有许多蛋白质含有2条或2条以上多肽链，才能全面地执行功能。

构成二级结构的主要化学键是氢键，二级结构包括：α-螺旋、β-折叠、β转角和无规则卷曲。

3目前机器学习在生物学领域有应用吗

有的，非常多，尤其在基因测序，蛋白质结构这方面。

机器学习在生物领域的应用实际上从90年代开始就已经开始了。比如早起的基因预测就是基于hmm实现的。现在随着各种noncoding rna的发现，这类应用也还不断存在。

我感觉在生物领域应用还是很多的，比如通过基因表达的信息预测疾病进展和患者的严重情况（死亡率），通过脑成像数据预测和诊断阿尔兹海默等等。

合成生物学本质上算是基因工程高级应用，作为想要控制生物的学科，和机器人研究一样，研究前景是无限的，只要你想得到，就能做到。

机器学习的主要应用：我主要看过的文章是TCGA对各个肿瘤的分子数据分析，共性便是利用分子数据做subtyping。机器学习的非监督学习在这里起到巨大作用。

4蛋白质结构预测方法是功能的突破性因素吗

了解一个生物过程所需的关键信息之一是其组成蛋白的结构，但结构测定的实验方法往往耗时费力，而且结果不确定，需要投入大量的时间和资源。相比之下，蛋白质序列很容易通过翻译基因组序列获得，并且可以获得大量的蛋白质。

序列相似性比对。通常情况下，蛋白质功能的预测方法采用序列相似性比对，结构和保守区分析等。序列相似性比对是蛋白质功能预测的最重要方法。

蛋白质是由氨基酸链构成的聚合物，通常由20种不同的氨基酸构成。其次级结构是-螺旋和-折叠，最终形成特定的三级结构。蛋白质的功能取决于其结构。酶类蛋白质 酶是一种蛋白质，可以加速化学反应。

蛋白质在理化因素作用下，使蛋白质分子的空间结构破坏，理化性质及生物学活性丧失的过程。引起蛋白质变形的因素举例。

作为结构基因组研究的互补，蛋白质结构预测的目标是发展出有效的能够提供未知结构(未通过实验方法得到)蛋白质的可信的结构模型。目前最为成功的结构预测方法是同源建模；这一方法是利用序列相似的蛋白质(已知结构)的结构作为“模板”。

蛋白质空间结构与功能的关系：特定的空间结构是行使生物功能的基础。空间结构决定着蛋白质的生物学功能。蛋白质是生物体中含量最丰富的生物大分子，约占人体固体成分的45%，而在细胞中可达细胞干重的70%以上。

5蛋白质二级结构的基本单位是什么

1、多肽链以肽单元为基本单位，以Cα为旋转点形成右手螺旋，氨基酸残基的侧链基团伸向螺旋的外侧。肽单元（peptide unit），肽键中的4个原子及相邻的2个α-C原子重复形成的长链结构。

2、蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕的方式。其基本单位主要有α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则转曲四种类型。

3、氨基酸是组成蛋白质的基本单位。蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物高分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。

6目前,目前关于蛋白质的空间结构的预测有哪些方法和手段,效果如何?_百...

蛋白质三级结构测定主要有X射线衍射法、核磁共振技术、三维电镜重构技术三种方法。X线晶体衍射是最经典的测定生物大分子结构的方法。蛋白质晶体衍射中最大的难点就在于蛋白质的结晶，也在一定程度上限制了它的发展。

蛋白质结构分析方法：X射线晶体衍射分析和核磁共振 x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平，使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局，还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。

一级结构 一级结构就是组成蛋白质的氨基酸的排列顺序，也称氨基酸序列，这些氨基酸有肽键和二硫键结合在一起，就是肽链。

一级结构：组成蛋白质多肽链的线性氨基酸序列。二级结构：依靠不同氨基酸之间的C=O和N-H基团间的氢键形成的稳定结构，主要为α螺旋和β折叠。

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